Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA4P13612 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms