Protein–RNA interactions for Protein: P11309

PIM1, Serine/threonine-protein kinase pim-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIM1P11309 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIM1P11309 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIM1P11309 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIM1P11309 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIM1P11309 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIM1P11309 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIM1P11309 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIM1P11309 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIM1P11309 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIM1P11309 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIM1P11309 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIM1P11309 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms