Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms