Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U2AF1L5P0DN76 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms