Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms