Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX7O95931 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX7O95931 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.5 ms