Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C6orf47O95873 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms