Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms