Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRRTM2O43300 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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