Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARHGEF10O15013 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms