Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
GGTLC3B5MD39 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms