Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms