Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 GPD1-201ENST00000301149 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00587B1AMM8 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms