Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ISM1B1AKI9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230.5 ms