Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HACD1B0YJ81 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms