Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC160A6NGH7 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC160A6NGH7 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms