Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms