Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
U3KQV3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
U3KQV3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
U3KQV3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
U3KQV3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
U3KQV3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
U3KQV3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
U3KQV3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
U3KQV3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
U3KQV3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
U3KQV3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
U3KQV3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
U3KQV3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
U3KQV3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
U3KQV3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
U3KQV3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
U3KQV3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
U3KQV3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
U3KQV3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
U3KQV3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
U3KQV3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
U3KQV3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
U3KQV3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
U3KQV3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
U3KQV3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
U3KQV3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
U3KQV3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
U3KQV3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U3KQV3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U3KQV3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U3KQV3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U3KQV3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U3KQV3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U3KQV3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U3KQV3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
U3KQV3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
U3KQV3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U3KQV3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U3KQV3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U3KQV3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U3KQV3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U3KQV3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
U3KQV3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
U3KQV3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
U3KQV3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
U3KQV3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U3KQV3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
U3KQV3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
U3KQV3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
U3KQV3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
U3KQV3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
U3KQV3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
U3KQV3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
U3KQV3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
U3KQV3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
U3KQV3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
U3KQV3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
U3KQV3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
U3KQV3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
U3KQV3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
U3KQV3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
U3KQV3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
U3KQV3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
U3KQV3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
U3KQV3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
U3KQV3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
U3KQV3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
U3KQV3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
U3KQV3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
U3KQV3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
U3KQV3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
U3KQV3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
U3KQV3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
U3KQV3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
U3KQV3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
U3KQV3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
U3KQV3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
U3KQV3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
U3KQV3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
U3KQV3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
U3KQV3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U3KQV3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U3KQV3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U3KQV3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U3KQV3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
U3KQV3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
U3KQV3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
U3KQV3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
U3KQV3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
U3KQV3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
U3KQV3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
U3KQV3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
U3KQV3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U3KQV3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U3KQV3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U3KQV3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
U3KQV3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U3KQV3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
U3KQV3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
U3KQV3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms