Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP20Q9Y6A4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP20Q9Y6A4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP20Q9Y6A4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP20Q9Y6A4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP20Q9Y6A4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP20Q9Y6A4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP20Q9Y6A4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP20Q9Y6A4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP20Q9Y6A4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP20Q9Y6A4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CFAP20Q9Y6A4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CFAP20Q9Y6A4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CFAP20Q9Y6A4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP20Q9Y6A4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP20Q9Y6A4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms