Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y639

NPTN, Neuroplastin, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTNQ9Y639 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NPTNQ9Y639 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NPTNQ9Y639 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms