Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X4

NR2E3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E3Q9Y5X4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NR2E3Q9Y5X4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR2E3Q9Y5X4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR2E3Q9Y5X4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.2 ms