Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC1Q9Y5R8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC1Q9Y5R8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms