Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNPO3Q9Y5L0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNPO3Q9Y5L0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNPO3Q9Y5L0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms