Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4U1

MMACHC, Methylmalonic aciduria and homocystinuria type C protein, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMACHCQ9Y4U1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMACHCQ9Y4U1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMACHCQ9Y4U1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMACHCQ9Y4U1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MMACHCQ9Y4U1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMACHCQ9Y4U1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMACHCQ9Y4U1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMACHCQ9Y4U1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MMACHCQ9Y4U1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMACHCQ9Y4U1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMACHCQ9Y4U1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MMACHCQ9Y4U1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
MMACHCQ9Y4U1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMACHCQ9Y4U1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMACHCQ9Y4U1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMACHCQ9Y4U1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMACHCQ9Y4U1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMACHCQ9Y4U1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms