Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG4BQ9Y4P1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4BQ9Y4P1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4BQ9Y4P1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4BQ9Y4P1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4BQ9Y4P1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4BQ9Y4P1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4BQ9Y4P1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG4BQ9Y4P1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4BQ9Y4P1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4BQ9Y4P1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4BQ9Y4P1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4BQ9Y4P1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4BQ9Y4P1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4BQ9Y4P1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4BQ9Y4P1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4BQ9Y4P1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4BQ9Y4P1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4BQ9Y4P1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4BQ9Y4P1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4BQ9Y4P1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4BQ9Y4P1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4BQ9Y4P1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms