Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHTOPQ9Y3Y2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms