Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q8

TSC22D4, TSC22 domain family protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D4Q9Y3Q8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC22D4Q9Y3Q8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC22D4Q9Y3Q8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSC22D4Q9Y3Q8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms