Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMED5Q9Y3A6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMED5Q9Y3A6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms