Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX24Q9Y343 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX24Q9Y343 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX24Q9Y343 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX24Q9Y343 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX24Q9Y343 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX24Q9Y343 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX24Q9Y343 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX24Q9Y343 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX24Q9Y343 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX24Q9Y343 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX24Q9Y343 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX24Q9Y343 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX24Q9Y343 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX24Q9Y343 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX24Q9Y343 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX24Q9Y343 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX24Q9Y343 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX24Q9Y343 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX24Q9Y343 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX24Q9Y343 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX24Q9Y343 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms