Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERGIC3Q9Y282 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERGIC3Q9Y282 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms