Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GINS2Q9Y248 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GINS2Q9Y248 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GINS2Q9Y248 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GINS2Q9Y248 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GINS2Q9Y248 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GINS2Q9Y248 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GINS2Q9Y248 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GINS2Q9Y248 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms