Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HHLA3Q9XRX5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HHLA3Q9XRX5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HHLA3Q9XRX5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms