Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SATB2Q9UPW6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SATB2Q9UPW6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SATB2Q9UPW6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms