Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE2

RPH3AL, Rab effector Noc2, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPH3ALQ9UNE2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPH3ALQ9UNE2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPH3ALQ9UNE2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPH3ALQ9UNE2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPH3ALQ9UNE2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPH3ALQ9UNE2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPH3ALQ9UNE2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPH3ALQ9UNE2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPH3ALQ9UNE2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPH3ALQ9UNE2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPH3ALQ9UNE2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPH3ALQ9UNE2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPH3ALQ9UNE2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPH3ALQ9UNE2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPH3ALQ9UNE2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPH3ALQ9UNE2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPH3ALQ9UNE2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPH3ALQ9UNE2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPH3ALQ9UNE2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPH3ALQ9UNE2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPH3ALQ9UNE2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPH3ALQ9UNE2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPH3ALQ9UNE2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPH3ALQ9UNE2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPH3ALQ9UNE2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPH3ALQ9UNE2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPH3ALQ9UNE2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPH3ALQ9UNE2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPH3ALQ9UNE2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPH3ALQ9UNE2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPH3ALQ9UNE2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPH3ALQ9UNE2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms