Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
L1RE1Q9UN81 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
L1RE1Q9UN81 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
L1RE1Q9UN81 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms