Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCML1Q9UN30 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCML1Q9UN30 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCML1Q9UN30 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCML1Q9UN30 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCML1Q9UN30 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCML1Q9UN30 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCML1Q9UN30 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCML1Q9UN30 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCML1Q9UN30 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCML1Q9UN30 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCML1Q9UN30 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCML1Q9UN30 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCML1Q9UN30 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCML1Q9UN30 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCML1Q9UN30 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCML1Q9UN30 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCML1Q9UN30 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCML1Q9UN30 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 322.9 ms