Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CIZ1Q9ULV3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CIZ1Q9ULV3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CIZ1Q9ULV3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms