Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ9

PCOLCE2, Procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2Q9UKZ9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCOLCE2Q9UKZ9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCOLCE2Q9UKZ9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCOLCE2Q9UKZ9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms