Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMFRQ9UKV5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AMFRQ9UKV5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AMFRQ9UKV5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms