Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN16Q9UKR8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN16Q9UKR8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN16Q9UKR8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms