Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXL4Q9UKA2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXL4Q9UKA2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXL4Q9UKA2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXL4Q9UKA2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXL4Q9UKA2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXL4Q9UKA2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FBXL4Q9UKA2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXL4Q9UKA2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXL4Q9UKA2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms