Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK11

ZNF223, Zinc finger protein 223, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF223Q9UK11 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF223Q9UK11 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF223Q9UK11 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF223Q9UK11 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF223Q9UK11 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF223Q9UK11 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF223Q9UK11 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF223Q9UK11 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF223Q9UK11 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF223Q9UK11 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF223Q9UK11 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF223Q9UK11 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF223Q9UK11 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF223Q9UK11 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF223Q9UK11 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF223Q9UK11 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF223Q9UK11 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF223Q9UK11 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF223Q9UK11 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF223Q9UK11 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF223Q9UK11 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF223Q9UK11 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF223Q9UK11 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF223Q9UK11 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF223Q9UK11 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF223Q9UK11 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF223Q9UK11 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF223Q9UK11 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF223Q9UK11 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF223Q9UK11 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms