Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C3orf18Q9UK00 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C3orf18Q9UK00 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C3orf18Q9UK00 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms