Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DCTN4Q9UJW0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCTN4Q9UJW0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DCTN4Q9UJW0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCTN4Q9UJW0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCTN4Q9UJW0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCTN4Q9UJW0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCTN4Q9UJW0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCTN4Q9UJW0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCTN4Q9UJW0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCTN4Q9UJW0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCTN4Q9UJW0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCTN4Q9UJW0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCTN4Q9UJW0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DCTN4Q9UJW0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCTN4Q9UJW0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCTN4Q9UJW0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCTN4Q9UJW0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCTN4Q9UJW0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCTN4Q9UJW0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms