Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RABGEF1Q9UJ41 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RABGEF1Q9UJ41 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RABGEF1Q9UJ41 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms