Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEFF2Q9UIK5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms