Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHORDC1Q9UHD1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHORDC1Q9UHD1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHORDC1Q9UHD1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms