Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGXB4Q9UGU5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGXB4Q9UGU5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGXB4Q9UGU5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGXB4Q9UGU5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGXB4Q9UGU5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGXB4Q9UGU5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HMGXB4Q9UGU5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HMGXB4Q9UGU5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms