Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGXB4Q9UGU5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGXB4Q9UGU5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGXB4Q9UGU5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGXB4Q9UGU5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGXB4Q9UGU5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGXB4Q9UGU5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HMGXB4Q9UGU5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HMGXB4Q9UGU5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGXB4Q9UGU5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGXB4Q9UGU5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms