Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TCF20Q9UGU0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCF20Q9UGU0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCF20Q9UGU0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms