Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA9Q9UGM1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNA9Q9UGM1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA9Q9UGM1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms